Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
DUSP28Q4G0W2 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
DUSP28Q4G0W2 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms