Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 ZFYVE27-201ENST00000337540 2927 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 TBC1D22B-201ENST00000373491 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 EPN2-202ENST00000347697 4664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 INTS6-201ENST00000311234 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 ITGA3-201ENST00000007722 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 DQX1-202ENST00000404568 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 RNF111-201ENST00000348370 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 MCRIP1-212ENST00000576730 2979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 AOC3-201ENST00000308423 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 SYMPK-214ENST00000599814 6537 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 KDM3A-216ENST00000542128 4311 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 TRABD2B-202ENST00000606738 7034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 USP22-206ENST00000537526 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 PACSIN2-202ENST00000337959 3149 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 NMRAL2P-204ENST00000423298 1792 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 KRT78-202ENST00000359499 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 KRT17P5-202ENST00000444070 2552 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 ATG16L1-202ENST00000373525 2767 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 DHX34-201ENST00000328771 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 FBN1-201ENST00000316623 11756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 USP6NL-205ENST00000609104 11377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 PLEKHB2-202ENST00000403716 4349 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 AL358933.1-201ENST00000565046 2830 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 AC022497.1-201ENST00000624916 3691 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 FAM76A-204ENST00000373954 3567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
RNF212Q495C1 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms