Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYB3

FOXD4L6, Forkhead box protein D4-like 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L6Q3SYB3 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
FOXD4L6Q3SYB3 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FOXD4L6Q3SYB3 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms