Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
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NDUFA9Q16795 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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NDUFA9Q16795 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
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NDUFA9Q16795 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
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NDUFA9Q16795 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
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NDUFA9Q16795 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
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NDUFA9Q16795 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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NDUFA9Q16795 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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NDUFA9Q16795 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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NDUFA9Q16795 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
NDUFA9Q16795 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
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