Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
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FXNQ16595 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
FXNQ16595 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FXNQ16595 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FXNQ16595 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FXNQ16595 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FXNQ16595 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
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FXNQ16595 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FXNQ16595 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
FXNQ16595 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FXNQ16595 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FXNQ16595 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FXNQ16595 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FXNQ16595 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FXNQ16595 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FXNQ16595 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FXNQ16595 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FXNQ16595 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FXNQ16595 KRTAP10-4-201ENST00000400374 1643 ntAPPRIS P2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FXNQ16595 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FXNQ16595 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FXNQ16595 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
FXNQ16595 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
FXNQ16595 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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FXNQ16595 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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FXNQ16595 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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FXNQ16595 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FXNQ16595 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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FXNQ16595 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
FXNQ16595 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
FXNQ16595 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FXNQ16595 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
FXNQ16595 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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FXNQ16595 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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FXNQ16595 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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FXNQ16595 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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FXNQ16595 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FXNQ16595 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FXNQ16595 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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FXNQ16595 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FXNQ16595 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FXNQ16595 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FXNQ16595 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FXNQ16595 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FXNQ16595 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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