Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
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RPE65Q16518 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
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RPE65Q16518 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
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RPE65Q16518 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
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RPE65Q16518 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
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RPE65Q16518 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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RPE65Q16518 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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RPE65Q16518 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
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RPE65Q16518 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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RPE65Q16518 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
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RPE65Q16518 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RPE65Q16518 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
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