Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SSX1Q16384 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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SSX1Q16384 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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