Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 NCAPG-201ENST00000251496 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 AC010336.1-201ENST00000539278 4739 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 RALGPS1-201ENST00000259351 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 STRIP2-201ENST00000249344 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 SCN8A-209ENST00000627620 5943 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 SPTB-203ENST00000389721 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 MYO9B-206ENST00000595618 7623 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 ATP7B-202ENST00000344297 5861 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 HLCS-207ENST00000612277 6112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 UGT3A1-201ENST00000274278 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 ZNF621-202ENST00000339296 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 RTL10-201ENST00000328554 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
ZNF56Q15929 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms