Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 TMEM260-201ENST00000261556 4264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 DHX37-201ENST00000308736 4550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 4625 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 NFKB1-202ENST00000394820 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 TMEM229B-207ENST00000557006 3941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
NEDD8Q15843 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 SCN2B-201ENST00000278947 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 AC022400.8-201ENST00000623453 3599 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 ATXN2L-225ENST00000570200 3635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 DDX54-201ENST00000306014 4377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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NEDD8Q15843 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 NTNG1-206ENST00000370071 3149 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 HTR5A-201ENST00000287907 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 CACNA1G-226ENST00000513689 6879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 CACNA1G-231ENST00000515165 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 FBRSL1-205ENST00000542061 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
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