Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TRIP4Q15650 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRIP4Q15650 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms