Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TRIP13Q15645 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIP13Q15645 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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