Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
RAB35Q15286 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms