Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PDCD1Q15116 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PDCD1Q15116 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
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