Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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NCAPHQ15003 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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NCAPHQ15003 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
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NCAPHQ15003 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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NCAPHQ15003 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NCAPHQ15003 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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