Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 Z95624.1-201ENST00000413528 628 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 C5orf63-203ENST00000509733 553 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 AC120498.7-201ENST00000562876 330 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 MIR4746-201ENST00000579802 71 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 AC008906.2-201ENST00000606656 474 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 HHLA3-202ENST00000361764 692 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 RPL14-203ENST00000416518 812 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 KRT8P30-201ENST00000432100 650 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 AC009163.5-202ENST00000571737 466 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 IGKV1OR-2-201ENST00000457995 350 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 SLC9A3R2-204ENST00000563587 1037 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 AC007193.3-201ENST00000598616 188 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 MCM8-AS1-201ENST00000613522 983 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 AC010531.8-201ENST00000623341 685 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GAPVD1Q14C86 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 NECTIN1-203ENST00000341398 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 AC080013.5-201ENST00000607044 679 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 NNMT-203ENST00000535401 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 RNF212-201ENST00000333673 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GAPVD1Q14C86 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
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