Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NEUROD1Q13562 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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