Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HDAC1Q13547 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
HDAC1Q13547 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms