Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TCIRG1Q13488 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
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