Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
XRCC4Q13426 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
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