Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CHAF1AQ13111 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
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