Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP3Q12983 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP3Q12983 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP3Q12983 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP3Q12983 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP3Q12983 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP3Q12983 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP3Q12983 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP3Q12983 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP3Q12983 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP3Q12983 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP3Q12983 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP3Q12983 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP3Q12983 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP3Q12983 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP3Q12983 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP3Q12983 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP3Q12983 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP3Q12983 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP3Q12983 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP3Q12983 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP3Q12983 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP3Q12983 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP3Q12983 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP3Q12983 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP3Q12983 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP3Q12983 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP3Q12983 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP3Q12983 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP3Q12983 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP3Q12983 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP3Q12983 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP3Q12983 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP3Q12983 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP3Q12983 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP3Q12983 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP3Q12983 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP3Q12983 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP3Q12983 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP3Q12983 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP3Q12983 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP3Q12983 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP3Q12983 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP3Q12983 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP3Q12983 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP3Q12983 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP3Q12983 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP3Q12983 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP3Q12983 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP3Q12983 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP3Q12983 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP3Q12983 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP3Q12983 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP3Q12983 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP3Q12983 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP3Q12983 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BNIP3Q12983 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BNIP3Q12983 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BNIP3Q12983 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BNIP3Q12983 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
BNIP3Q12983 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BNIP3Q12983 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BNIP3Q12983 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BNIP3Q12983 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BNIP3Q12983 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BNIP3Q12983 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BNIP3Q12983 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BNIP3Q12983 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BNIP3Q12983 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BNIP3Q12983 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BNIP3Q12983 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BNIP3Q12983 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BNIP3Q12983 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BNIP3Q12983 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BNIP3Q12983 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BNIP3Q12983 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BNIP3Q12983 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BNIP3Q12983 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BNIP3Q12983 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
BNIP3Q12983 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BNIP3Q12983 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BNIP3Q12983 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BNIP3Q12983 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
BNIP3Q12983 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BNIP3Q12983 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BNIP3Q12983 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BNIP3Q12983 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BNIP3Q12983 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BNIP3Q12983 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BNIP3Q12983 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BNIP3Q12983 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BNIP3Q12983 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BNIP3Q12983 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
BNIP3Q12983 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
BNIP3Q12983 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BNIP3Q12983 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BNIP3Q12983 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BNIP3Q12983 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BNIP3Q12983 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BNIP3Q12983 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms