Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 COLQ-202ENST00000383786 1482 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 DYNLT1-201ENST00000367085 774 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 EEF1DP5-201ENST00000431410 772 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 AL355306.2-209ENST00000437803 357 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 RHOQP2-201ENST00000449922 579 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 AC087071.1-201ENST00000469264 427 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 AC090833.1-202ENST00000511073 781 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 C11orf1-202ENST00000528125 534 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 AC140847.2-201ENST00000545923 501 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 CR392039.1-201ENST00000623217 204 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 C18orf21-202ENST00000333234 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 OLA1P2-201ENST00000395519 1264 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 AC010900.1-201ENST00000449849 1296 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 AP003351.1-201ENST00000522743 668 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 AC007656.1-201ENST00000552238 573 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 AC009163.5-202ENST00000571737 466 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 MIR4254-201ENST00000581063 76 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 RBFOX3-206ENST00000582043 1143 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 AC092073.1-202ENST00000606020 653 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 MCM8-AS1-201ENST00000613522 983 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
FOXC1Q12948 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms