Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 PTPN20-229ENST00000513756 640 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 AP000640.1-201ENST00000525337 879 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 SHBG-217ENST00000576478 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 AC022098.2-201ENST00000590528 518 ntTSL 4 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 AP001462.1-201ENST00000594089 452 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 PLA2G4C-AS1-203ENST00000601950 454 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 CCDC32-215ENST00000625629 801 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 AC002511.3-201ENST00000638098 420 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 RPAIN-202ENST00000381208 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 LINC00205-201ENST00000433465 1391 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 CD3G-202ENST00000392883 1179 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 AC079325.1-201ENST00000430386 857 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 KRT127P-201ENST00000547183 433 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 AL031705.1-201ENST00000566922 682 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 AC011483.3-201ENST00000601506 826 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 KCNQ1OT1_1.1-201ENST00000622358 464 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 AC010531.8-201ENST00000623341 685 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.39
PTPN13Q12923 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 LINC02507-201ENST00000509370 1028 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 C11orf58-207ENST00000525684 575 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
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PTPN13Q12923 C11orf58-209ENST00000528634 776 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
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PTPN13Q12923 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
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PTPN13Q12923 MIR6819-201ENST00000622122 61 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 PAX8-AS1-219ENST00000623306 840 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 RRNAD1-204ENST00000476229 1096 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 BLOC1S1-202ENST00000548556 525 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 SLC25A3-215ENST00000551265 580 ntTSL 4 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 ACTBP9-201ENST00000587663 1099 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
PTPN13Q12923 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
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