Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
CHRNB3Q05901 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms