Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 RN7SKP149-201ENST00000363008 344 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 RPL31-203ENST00000409028 1110 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 ADH5P4-201ENST00000433151 1110 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 AC022540.1-201ENST00000448214 965 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 AC146944.2-201ENST00000504546 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 AC139495.1-201ENST00000510264 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 AC023825.1-201ENST00000566704 1030 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 LYZL6-201ENST00000615905 1047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 AP003499.2-201ENST00000624100 483 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 TUBD1-203ENST00000346141 1490 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 PTPN11-205ENST00000635625 1794 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 FIGN-202ENST00000409634 746 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 AC092447.4-201ENST00000436042 673 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 AL139220.1-201ENST00000436802 520 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 LINC00448-202ENST00000448411 433 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 SNAP25-AS1-204ENST00000451151 867 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 TMEM161B-AS1-207ENST00000506584 717 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 AC027373.1-201ENST00000564694 1142 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CACNB1Q02641 AC104984.6-201ENST00000591928 360 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms