Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CACNA1BQ00975 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CACNA1BQ00975 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CACNA1BQ00975 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CACNA1BQ00975 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CACNA1BQ00975 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CACNA1BQ00975 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CACNA1BQ00975 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CACNA1BQ00975 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CACNA1BQ00975 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CACNA1BQ00975 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CACNA1BQ00975 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CACNA1BQ00975 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CACNA1BQ00975 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CACNA1BQ00975 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CACNA1BQ00975 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CACNA1BQ00975 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CACNA1BQ00975 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CACNA1BQ00975 GAPDH-202ENST00000396856 1266 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CACNA1BQ00975 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CACNA1BQ00975 NME6-211ENST00000447314 621 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CACNA1BQ00975 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CACNA1BQ00975 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CACNA1BQ00975 SNRPN-208ENST00000577565 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CACNA1BQ00975 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CACNA1BQ00975 SMIM22-207ENST00000589721 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CACNA1BQ00975 MIR6749-201ENST00000617008 69 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CACNA1BQ00975 AC022167.5-201ENST00000636296 1250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CACNA1BQ00975 AC137936.2-202ENST00000638124 1146 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CACNA1BQ00975 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CACNA1BQ00975 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CACNA1BQ00975 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CACNA1BQ00975 CEBPZOS-203ENST00000397226 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CACNA1BQ00975 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CACNA1BQ00975 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CACNA1BQ00975 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CACNA1BQ00975 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CACNA1BQ00975 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CACNA1BQ00975 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CACNA1BQ00975 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CACNA1BQ00975 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CACNA1BQ00975 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CACNA1BQ00975 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CACNA1BQ00975 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CACNA1BQ00975 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CACNA1BQ00975 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CACNA1BQ00975 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CACNA1BQ00975 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CACNA1BQ00975 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CACNA1BQ00975 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CACNA1BQ00975 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CACNA1BQ00975 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CACNA1BQ00975 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CACNA1BQ00975 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CACNA1BQ00975 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CACNA1BQ00975 PDCD6-201ENST00000264933 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CACNA1BQ00975 AC011284.1-201ENST00000427920 856 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CACNA1BQ00975 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CACNA1BQ00975 PARVG-208ENST00000466375 820 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CACNA1BQ00975 IGKV2-28-201ENST00000482769 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CACNA1BQ00975 AC004889.1-201ENST00000498693 856 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CACNA1BQ00975 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CACNA1BQ00975 TIMM10-202ENST00000525158 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CACNA1BQ00975 AL162231.1-205ENST00000544078 338 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CACNA1BQ00975 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CACNA1BQ00975 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CACNA1BQ00975 BOLA3P2-201ENST00000586496 323 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CACNA1BQ00975 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CACNA1BQ00975 MIR6741-201ENST00000618782 63 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CACNA1BQ00975 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CACNA1BQ00975 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CACNA1BQ00975 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CACNA1BQ00975 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CACNA1BQ00975 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CACNA1BQ00975 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CACNA1BQ00975 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CACNA1BQ00975 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CACNA1BQ00975 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CACNA1BQ00975 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CACNA1BQ00975 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CACNA1BQ00975 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CACNA1BQ00975 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CACNA1BQ00975 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CACNA1BQ00975 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CACNA1BQ00975 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CACNA1BQ00975 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CACNA1BQ00975 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CACNA1BQ00975 AL162151.1-201ENST00000423922 561 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CACNA1BQ00975 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CACNA1BQ00975 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CACNA1BQ00975 LINC01664-202ENST00000441544 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CACNA1BQ00975 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CACNA1BQ00975 AC104117.4-201ENST00000521486 847 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CACNA1BQ00975 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CACNA1BQ00975 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CACNA1BQ00975 NPAS3-209ENST00000551008 1002 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CACNA1BQ00975 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CACNA1BQ00975 FXYD3-210ENST00000604621 548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CACNA1BQ00975 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CACNA1BQ00975 PAX6-247ENST00000638965 979 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms