Protein–RNA interactions for Protein: P78312

FAM193A, Protein FAM193A, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM193AP78312 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM193AP78312 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM193AP78312 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM193AP78312 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM193AP78312 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM193AP78312 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM193AP78312 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM193AP78312 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM193AP78312 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM193AP78312 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM193AP78312 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM193AP78312 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM193AP78312 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM193AP78312 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM193AP78312 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM193AP78312 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM193AP78312 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM193AP78312 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM193AP78312 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM193AP78312 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM193AP78312 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM193AP78312 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM193AP78312 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM193AP78312 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM193AP78312 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM193AP78312 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FAM193AP78312 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM193AP78312 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM193AP78312 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM193AP78312 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM193AP78312 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM193AP78312 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM193AP78312 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM193AP78312 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM193AP78312 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM193AP78312 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM193AP78312 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM193AP78312 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM193AP78312 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM193AP78312 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM193AP78312 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM193AP78312 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM193AP78312 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM193AP78312 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM193AP78312 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM193AP78312 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM193AP78312 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM193AP78312 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM193AP78312 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM193AP78312 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM193AP78312 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM193AP78312 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM193AP78312 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM193AP78312 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM193AP78312 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM193AP78312 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM193AP78312 DNAJC11-202ENST00000377577 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM193AP78312 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM193AP78312 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM193AP78312 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM193AP78312 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM193AP78312 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM193AP78312 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM193AP78312 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM193AP78312 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM193AP78312 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM193AP78312 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM193AP78312 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM193AP78312 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM193AP78312 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM193AP78312 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM193AP78312 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM193AP78312 FANCC-210ENST00000490972 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM193AP78312 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM193AP78312 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM193AP78312 DNM1P41-201ENST00000623634 3350 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM193AP78312 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM193AP78312 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM193AP78312 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM193AP78312 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM193AP78312 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM193AP78312 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM193AP78312 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM193AP78312 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM193AP78312 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM193AP78312 PI4KAP2-211ENST00000486209 3213 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM193AP78312 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM193AP78312 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM193AP78312 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM193AP78312 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM193AP78312 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM193AP78312 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM193AP78312 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM193AP78312 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM193AP78312 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM193AP78312 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM193AP78312 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM193AP78312 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM193AP78312 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM193AP78312 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms