Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ERVK-24P63145 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ERVK-24P63145 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ERVK-24P63145 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ERVK-24P63145 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ERVK-24P63145 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ERVK-24P63145 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ERVK-24P63145 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ERVK-24P63145 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ERVK-24P63145 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ERVK-24P63145 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ERVK-24P63145 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVK-24P63145 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVK-24P63145 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVK-24P63145 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVK-24P63145 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVK-24P63145 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVK-24P63145 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVK-24P63145 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVK-24P63145 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVK-24P63145 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ERVK-24P63145 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms