Protein–RNA interactions for Protein: P62306

SNRPF, Small nuclear ribonucleoprotein F, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPFP62306 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPFP62306 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPFP62306 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPFP62306 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPFP62306 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPFP62306 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPFP62306 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPFP62306 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPFP62306 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPFP62306 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPFP62306 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPFP62306 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPFP62306 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPFP62306 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPFP62306 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPFP62306 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPFP62306 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPFP62306 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPFP62306 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPFP62306 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPFP62306 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPFP62306 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNRPFP62306 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPFP62306 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPFP62306 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPFP62306 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPFP62306 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPFP62306 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPFP62306 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPFP62306 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPFP62306 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPFP62306 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPFP62306 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPFP62306 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPFP62306 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPFP62306 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPFP62306 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPFP62306 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPFP62306 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPFP62306 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPFP62306 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPFP62306 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPFP62306 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPFP62306 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPFP62306 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPFP62306 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPFP62306 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPFP62306 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPFP62306 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPFP62306 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPFP62306 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPFP62306 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPFP62306 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPFP62306 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPFP62306 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPFP62306 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPFP62306 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPFP62306 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPFP62306 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPFP62306 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SNRPFP62306 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPFP62306 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPFP62306 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPFP62306 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPFP62306 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPFP62306 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPFP62306 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPFP62306 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPFP62306 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPFP62306 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPFP62306 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPFP62306 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPFP62306 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPFP62306 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPFP62306 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPFP62306 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPFP62306 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPFP62306 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPFP62306 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPFP62306 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPFP62306 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPFP62306 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPFP62306 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPFP62306 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPFP62306 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPFP62306 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPFP62306 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPFP62306 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPFP62306 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPFP62306 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPFP62306 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPFP62306 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPFP62306 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPFP62306 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPFP62306 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPFP62306 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPFP62306 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPFP62306 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPFP62306 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SNRPFP62306 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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