Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP46P62068 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP46P62068 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP46P62068 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP46P62068 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP46P62068 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP46P62068 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP46P62068 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP46P62068 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP46P62068 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP46P62068 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP46P62068 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP46P62068 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP46P62068 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP46P62068 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
USP46P62068 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP46P62068 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP46P62068 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP46P62068 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP46P62068 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP46P62068 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP46P62068 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP46P62068 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP46P62068 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP46P62068 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP46P62068 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP46P62068 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP46P62068 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP46P62068 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP46P62068 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP46P62068 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP46P62068 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP46P62068 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP46P62068 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP46P62068 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP46P62068 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP46P62068 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP46P62068 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP46P62068 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP46P62068 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP46P62068 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP46P62068 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP46P62068 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
USP46P62068 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
USP46P62068 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP46P62068 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
USP46P62068 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP46P62068 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP46P62068 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP46P62068 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP46P62068 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
USP46P62068 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP46P62068 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
USP46P62068 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP46P62068 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP46P62068 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP46P62068 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP46P62068 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP46P62068 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP46P62068 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP46P62068 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP46P62068 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP46P62068 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP46P62068 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP46P62068 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP46P62068 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP46P62068 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
USP46P62068 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP46P62068 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP46P62068 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP46P62068 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP46P62068 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP46P62068 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP46P62068 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP46P62068 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP46P62068 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP46P62068 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP46P62068 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP46P62068 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP46P62068 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP46P62068 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP46P62068 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP46P62068 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP46P62068 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP46P62068 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP46P62068 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP46P62068 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP46P62068 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP46P62068 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP46P62068 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
USP46P62068 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
USP46P62068 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
USP46P62068 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP46P62068 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP46P62068 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP46P62068 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP46P62068 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP46P62068 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP46P62068 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
USP46P62068 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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