Protein–RNA interactions for Protein: P54852

EMP3, Epithelial membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP3P54852 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMP3P54852 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMP3P54852 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMP3P54852 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMP3P54852 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMP3P54852 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMP3P54852 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMP3P54852 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMP3P54852 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMP3P54852 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMP3P54852 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMP3P54852 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
EMP3P54852 PGM5-AS1-202ENST00000420855 572 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMP3P54852 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMP3P54852 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
EMP3P54852 AL731577.1-201ENST00000449984 830 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMP3P54852 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
EMP3P54852 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMP3P54852 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
EMP3P54852 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
EMP3P54852 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
EMP3P54852 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
EMP3P54852 TSPAN19-204ENST00000532498 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMP3P54852 ETFRF1-211ENST00000557540 1259 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMP3P54852 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
EMP3P54852 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
EMP3P54852 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMP3P54852 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMP3P54852 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMP3P54852 BX255923.1-201ENST00000613309 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMP3P54852 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMP3P54852 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMP3P54852 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMP3P54852 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMP3P54852 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMP3P54852 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMP3P54852 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMP3P54852 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMP3P54852 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMP3P54852 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMP3P54852 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMP3P54852 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
EMP3P54852 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMP3P54852 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMP3P54852 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMP3P54852 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMP3P54852 HVCN1-209ENST00000620084 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMP3P54852 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMP3P54852 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMP3P54852 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMP3P54852 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMP3P54852 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMP3P54852 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
EMP3P54852 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMP3P54852 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMP3P54852 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMP3P54852 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMP3P54852 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EMP3P54852 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EMP3P54852 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
EMP3P54852 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EMP3P54852 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EMP3P54852 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EMP3P54852 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EMP3P54852 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EMP3P54852 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EMP3P54852 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EMP3P54852 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EMP3P54852 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EMP3P54852 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EMP3P54852 PRKAA1-201ENST00000296800 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EMP3P54852 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EMP3P54852 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EMP3P54852 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EMP3P54852 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EMP3P54852 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EMP3P54852 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EMP3P54852 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EMP3P54852 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EMP3P54852 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EMP3P54852 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EMP3P54852 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
EMP3P54852 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EMP3P54852 ATP6AP2-204ENST00000447485 1254 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EMP3P54852 AC096736.3-201ENST00000510753 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EMP3P54852 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EMP3P54852 AC122713.1-201ENST00000518368 1015 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
EMP3P54852 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EMP3P54852 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EMP3P54852 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EMP3P54852 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
EMP3P54852 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EMP3P54852 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EMP3P54852 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EMP3P54852 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EMP3P54852 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EMP3P54852 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EMP3P54852 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EMP3P54852 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EMP3P54852 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms