Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ATRXP46100 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATRXP46100 C1orf87-202ENST00000450089 1307 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATRXP46100 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATRXP46100 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATRXP46100 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATRXP46100 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATRXP46100 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATRXP46100 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATRXP46100 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATRXP46100 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATRXP46100 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATRXP46100 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATRXP46100 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATRXP46100 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATRXP46100 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATRXP46100 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATRXP46100 VGLL1-201ENST00000370634 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATRXP46100 LINC02344-201ENST00000443576 644 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATRXP46100 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATRXP46100 SMIM15-202ENST00000507416 584 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATRXP46100 CCNL2P1-201ENST00000512846 969 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ATRXP46100 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ATRXP46100 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ATRXP46100 ABCC6P1-203ENST00000565566 1170 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ATRXP46100 AC091304.3-201ENST00000566500 716 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ATRXP46100 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATRXP46100 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ATRXP46100 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ATRXP46100 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.28
ATRXP46100 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ATRXP46100 GOSR2-231ENST00000640007 1425 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
ATRXP46100 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ATRXP46100 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ATRXP46100 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ATRXP46100 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ATRXP46100 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ATRXP46100 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ATRXP46100 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ATRXP46100 MTA3-204ENST00000406911 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
ATRXP46100 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ATRXP46100 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
ATRXP46100 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
ATRXP46100 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ATRXP46100 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
ATRXP46100 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
ATRXP46100 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
ATRXP46100 UCN3-201ENST00000380433 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATRXP46100 PPP1R2P10-201ENST00000393023 595 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
ATRXP46100 RIBC1-203ENST00000414955 1281 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATRXP46100 RPL15-208ENST00000435882 1063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATRXP46100 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATRXP46100 AC103563.2-201ENST00000442200 597 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATRXP46100 RN7SL487P-201ENST00000468140 344 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
ATRXP46100 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
ATRXP46100 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
ATRXP46100 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
ATRXP46100 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
ATRXP46100 AP001462.1-201ENST00000594089 452 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
ATRXP46100 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATRXP46100 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
ATRXP46100 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATRXP46100 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATRXP46100 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATRXP46100 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATRXP46100 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATRXP46100 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATRXP46100 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATRXP46100 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATRXP46100 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATRXP46100 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATRXP46100 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATRXP46100 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATRXP46100 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATRXP46100 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATRXP46100 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATRXP46100 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATRXP46100 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATRXP46100 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATRXP46100 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATRXP46100 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATRXP46100 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATRXP46100 CCL17-201ENST00000219244 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATRXP46100 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATRXP46100 CD79B-203ENST00000392795 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATRXP46100 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
ATRXP46100 LINC01833-204ENST00000444871 581 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATRXP46100 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATRXP46100 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATRXP46100 AC246817.2-204ENST00000517984 562 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATRXP46100 MBP-230ENST00000528160 584 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATRXP46100 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATRXP46100 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
ATRXP46100 LINC01002-223ENST00000633179 407 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATRXP46100 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ATRXP46100 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRXP46100 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRXP46100 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRXP46100 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ATRXP46100 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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