Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ATP5C1P36542 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ATP5C1P36542 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.4 ms