Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HOXA7P31268 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms