Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CNGA1P29973 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CNGA1P29973 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms