Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC12.3□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 PER3-208ENST00000613533 6318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC12.29□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
IL3RAP26951 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms