Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PLNP26678 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PLNP26678 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PLNP26678 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PLNP26678 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PLNP26678 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PLNP26678 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PLNP26678 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PLNP26678 FAM225A-202ENST00000453010 5625 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PLNP26678 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PLNP26678 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
PLNP26678 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PLNP26678 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PLNP26678 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PLNP26678 SPG11-203ENST00000535302 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PLNP26678 CCDC92-208ENST00000545135 4883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PLNP26678 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
PLNP26678 EBF2-203ENST00000520164 5145 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PLNP26678 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PLNP26678 ST5-256ENST00000534127 4545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PLNP26678 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PLNP26678 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PLNP26678 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PLNP26678 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
PLNP26678 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PLNP26678 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PLNP26678 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PLNP26678 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PLNP26678 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PLNP26678 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PLNP26678 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PLNP26678 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PLNP26678 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PLNP26678 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PLNP26678 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PLNP26678 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PLNP26678 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PLNP26678 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PLNP26678 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PLNP26678 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
PLNP26678 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
PLNP26678 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PLNP26678 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PLNP26678 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PLNP26678 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PLNP26678 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PLNP26678 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PLNP26678 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PLNP26678 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
PLNP26678 ADARB1-214ENST00000629643 4583 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PLNP26678 EXOC8-201ENST00000366645 5100 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PLNP26678 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PLNP26678 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PLNP26678 CEP78-205ENST00000424347 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PLNP26678 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PLNP26678 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PLNP26678 MKL1-211ENST00000618196 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PLNP26678 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PLNP26678 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PLNP26678 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PLNP26678 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PLNP26678 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PLNP26678 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PLNP26678 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PLNP26678 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PLNP26678 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PLNP26678 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PLNP26678 AC005695.1-201ENST00000574307 5672 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PLNP26678 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PLNP26678 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PLNP26678 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PLNP26678 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PLNP26678 SETD4-207ENST00000399215 4272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PLNP26678 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PLNP26678 ANKRD36B-204ENST00000438709 6067 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PLNP26678 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PLNP26678 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
PLNP26678 ZNF398-201ENST00000426851 5268 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PLNP26678 MYO18B-202ENST00000407587 8090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PLNP26678 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
PLNP26678 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PLNP26678 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PLNP26678 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PLNP26678 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PLNP26678 BCL2L11-217ENST00000610735 5120 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PLNP26678 COG5-201ENST00000297135 4060 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PLNP26678 TG-201ENST00000220616 8450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PLNP26678 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
PLNP26678 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PLNP26678 CCT3-204ENST00000368259 1815 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PLNP26678 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PLNP26678 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PLNP26678 SLC5A4-201ENST00000266086 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PLNP26678 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PLNP26678 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PLNP26678 SRC-204ENST00000373578 4630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
PLNP26678 XIRP1-201ENST00000340369 6460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PLNP26678 CAMTA2-204ENST00000414043 4589 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PLNP26678 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
PLNP26678 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms