Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HRCP23327 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HRCP23327 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HRCP23327 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HRCP23327 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HRCP23327 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HRCP23327 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HRCP23327 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HRCP23327 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HRCP23327 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HRCP23327 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HRCP23327 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
HRCP23327 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HRCP23327 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HRCP23327 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HRCP23327 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HRCP23327 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HRCP23327 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HRCP23327 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HRCP23327 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HRCP23327 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HRCP23327 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HRCP23327 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HRCP23327 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HRCP23327 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HRCP23327 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HRCP23327 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HRCP23327 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HRCP23327 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HRCP23327 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HRCP23327 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HRCP23327 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HRCP23327 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HRCP23327 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HRCP23327 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HRCP23327 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HRCP23327 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HRCP23327 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HRCP23327 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HRCP23327 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HRCP23327 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HRCP23327 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HRCP23327 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HRCP23327 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HRCP23327 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HRCP23327 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HRCP23327 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HRCP23327 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HRCP23327 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HRCP23327 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HRCP23327 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HRCP23327 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HRCP23327 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HRCP23327 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HRCP23327 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HRCP23327 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HRCP23327 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HRCP23327 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HRCP23327 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HRCP23327 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HRCP23327 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HRCP23327 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HRCP23327 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HRCP23327 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HRCP23327 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HRCP23327 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HRCP23327 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HRCP23327 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HRCP23327 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HRCP23327 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HRCP23327 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HRCP23327 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HRCP23327 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HRCP23327 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HRCP23327 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HRCP23327 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HRCP23327 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HRCP23327 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HRCP23327 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HRCP23327 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HRCP23327 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HRCP23327 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HRCP23327 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HRCP23327 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HRCP23327 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HRCP23327 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HRCP23327 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HRCP23327 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HRCP23327 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HRCP23327 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HRCP23327 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HRCP23327 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HRCP23327 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HRCP23327 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HRCP23327 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HRCP23327 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HRCP23327 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HRCP23327 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HRCP23327 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HRCP23327 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms