Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SDSP20132 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SDSP20132 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SDSP20132 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SDSP20132 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SDSP20132 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SDSP20132 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SDSP20132 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SDSP20132 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SDSP20132 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SDSP20132 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SDSP20132 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SDSP20132 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SDSP20132 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SDSP20132 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SDSP20132 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SDSP20132 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SDSP20132 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SDSP20132 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SDSP20132 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SDSP20132 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SDSP20132 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SDSP20132 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SDSP20132 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SDSP20132 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SDSP20132 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SDSP20132 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SDSP20132 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SDSP20132 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SDSP20132 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SDSP20132 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SDSP20132 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SDSP20132 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SDSP20132 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SDSP20132 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SDSP20132 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SDSP20132 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SDSP20132 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SDSP20132 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SDSP20132 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SDSP20132 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SDSP20132 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SDSP20132 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SDSP20132 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SDSP20132 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SDSP20132 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SDSP20132 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SDSP20132 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SDSP20132 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SDSP20132 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SDSP20132 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SDSP20132 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SDSP20132 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SDSP20132 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SDSP20132 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SDSP20132 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SDSP20132 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SDSP20132 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SDSP20132 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SDSP20132 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SDSP20132 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SDSP20132 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SDSP20132 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SDSP20132 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SDSP20132 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SDSP20132 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SDSP20132 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SDSP20132 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SDSP20132 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SDSP20132 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SDSP20132 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SDSP20132 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SDSP20132 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SDSP20132 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SDSP20132 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SDSP20132 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SDSP20132 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDSP20132 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDSP20132 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDSP20132 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDSP20132 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDSP20132 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDSP20132 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDSP20132 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDSP20132 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDSP20132 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDSP20132 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDSP20132 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDSP20132 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDSP20132 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SDSP20132 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SDSP20132 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SDSP20132 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDSP20132 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDSP20132 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDSP20132 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDSP20132 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDSP20132 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SDSP20132 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SDSP20132 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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