Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFTRP13569 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFTRP13569 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFTRP13569 LINC00205-201ENST00000433465 1391 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFTRP13569 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFTRP13569 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFTRP13569 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFTRP13569 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFTRP13569 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFTRP13569 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFTRP13569 TBC1D3P2-201ENST00000339120 1513 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFTRP13569 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFTRP13569 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFTRP13569 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFTRP13569 TMEM222-203ENST00000464813 1071 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFTRP13569 C11orf45-202ENST00000524878 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFTRP13569 AC004466.2-201ENST00000614749 516 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CFTRP13569 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFTRP13569 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFTRP13569 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFTRP13569 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFTRP13569 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFTRP13569 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFTRP13569 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFTRP13569 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFTRP13569 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFTRP13569 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFTRP13569 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFTRP13569 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFTRP13569 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFTRP13569 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFTRP13569 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFTRP13569 AC098657.1-201ENST00000416270 1135 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CFTRP13569 STAG3L3-203ENST00000436857 1033 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFTRP13569 CMPK1-204ENST00000450808 950 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFTRP13569 BLOC1S5-205ENST00000543936 368 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFTRP13569 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFTRP13569 LINC01490-202ENST00000551399 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFTRP13569 MKRN3-202ENST00000564592 629 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFTRP13569 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFTRP13569 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFTRP13569 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFTRP13569 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFTRP13569 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFTRP13569 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFTRP13569 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFTRP13569 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFTRP13569 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFTRP13569 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFTRP13569 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFTRP13569 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFTRP13569 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFTRP13569 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFTRP13569 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CFTRP13569 WWC2-208ENST00000508747 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFTRP13569 AC005993.1-201ENST00000555581 397 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFTRP13569 YWHAE-212ENST00000575977 540 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFTRP13569 LINC01029-202ENST00000578833 366 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFTRP13569 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFTRP13569 SIGLEC6-204ENST00000391797 1391 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFTRP13569 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFTRP13569 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFTRP13569 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFTRP13569 HTD2-205ENST00000477305 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFTRP13569 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFTRP13569 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFTRP13569 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFTRP13569 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFTRP13569 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFTRP13569 KRTAP2-3-201ENST00000391418 875 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFTRP13569 AL158207.2-201ENST00000414926 266 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFTRP13569 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFTRP13569 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFTRP13569 VDAC1P11-201ENST00000458323 852 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CFTRP13569 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CFTRP13569 ACY3-202ENST00000529256 933 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFTRP13569 AL357143.1-203ENST00000639750 881 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CFTRP13569 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFTRP13569 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFTRP13569 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFTRP13569 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFTRP13569 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFTRP13569 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFTRP13569 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFTRP13569 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFTRP13569 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFTRP13569 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFTRP13569 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFTRP13569 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFTRP13569 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFTRP13569 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFTRP13569 MPV17-207ENST00000403262 665 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFTRP13569 ATRAID-202ENST00000405489 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFTRP13569 AL591242.1-201ENST00000422284 343 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFTRP13569 RNU1-80P-201ENST00000459500 161 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CFTRP13569 AC104590.1-201ENST00000560813 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFTRP13569 AC091304.3-201ENST00000566500 716 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CFTRP13569 ZNF175-204ENST00000596504 580 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFTRP13569 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFTRP13569 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms