Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC172P0C7W6 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms