Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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ZBED1O96006 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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ZBED1O96006 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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ZBED1O96006 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZBED1O96006 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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