Protein–RNA interactions for Protein: O60941

DTNB, Dystrobrevin beta, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTNBO60941 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DTNBO60941 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DTNBO60941 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
DTNBO60941 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DTNBO60941 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DTNBO60941 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DTNBO60941 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
DTNBO60941 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DTNBO60941 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DTNBO60941 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
DTNBO60941 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DTNBO60941 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DTNBO60941 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
DTNBO60941 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DTNBO60941 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DTNBO60941 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DTNBO60941 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
DTNBO60941 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DTNBO60941 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DTNBO60941 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DTNBO60941 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DTNBO60941 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DTNBO60941 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DTNBO60941 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DTNBO60941 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DTNBO60941 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DTNBO60941 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DTNBO60941 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DTNBO60941 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DTNBO60941 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DTNBO60941 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DTNBO60941 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DTNBO60941 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DTNBO60941 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DTNBO60941 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DTNBO60941 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DTNBO60941 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DTNBO60941 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DTNBO60941 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DTNBO60941 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DTNBO60941 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DTNBO60941 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DTNBO60941 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DTNBO60941 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DTNBO60941 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DTNBO60941 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DTNBO60941 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DTNBO60941 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DTNBO60941 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DTNBO60941 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DTNBO60941 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DTNBO60941 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DTNBO60941 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DTNBO60941 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DTNBO60941 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DTNBO60941 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DTNBO60941 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DTNBO60941 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DTNBO60941 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DTNBO60941 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DTNBO60941 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DTNBO60941 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DTNBO60941 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DTNBO60941 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DTNBO60941 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DTNBO60941 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DTNBO60941 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DTNBO60941 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DTNBO60941 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DTNBO60941 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DTNBO60941 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DTNBO60941 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DTNBO60941 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DTNBO60941 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DTNBO60941 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DTNBO60941 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DTNBO60941 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DTNBO60941 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DTNBO60941 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DTNBO60941 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DTNBO60941 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DTNBO60941 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DTNBO60941 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DTNBO60941 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DTNBO60941 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DTNBO60941 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DTNBO60941 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DTNBO60941 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DTNBO60941 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DTNBO60941 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DTNBO60941 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DTNBO60941 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DTNBO60941 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DTNBO60941 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
DTNBO60941 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
DTNBO60941 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DTNBO60941 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DTNBO60941 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DTNBO60941 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
DTNBO60941 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms