Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 AC092723.2-201ENST00000624955 793 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA2O43364 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms