Protein–RNA interactions for Protein: O15554

KCNN4, Intermediate conductance calcium-activated potassium channel protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNN4O15554 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KCNN4O15554 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms