Protein–RNA interactions for Protein: H3BU77

CCDC179, Coiled-coil domain-containing protein 179, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC179H3BU77 RBM33-203ENST00000341148 7058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CCDC179H3BU77 CLCN4-202ENST00000380833 6750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CCDC179H3BU77 UBOX5-201ENST00000217173 4631 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CCDC179H3BU77 DCK-204ENST00000504952 2614 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CCDC179H3BU77 AC006372.3-201ENST00000444158 4049 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CCDC179H3BU77 PROSER2-AS1-201ENST00000445498 3146 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CCDC179H3BU77 N4BP2L1-204ENST00000380139 2994 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CCDC179H3BU77 HLA-F-AS1-209ENST00000458236 2835 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
CCDC179H3BU77 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CCDC179H3BU77 AC093583.1-201ENST00000462083 2383 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CCDC179H3BU77 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CCDC179H3BU77 TMEM192-203ENST00000506087 2225 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CCDC179H3BU77 AL353593.1-201ENST00000602517 3955 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
CCDC179H3BU77 FAM214B-201ENST00000322813 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CCDC179H3BU77 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CCDC179H3BU77 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CCDC179H3BU77 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CCDC179H3BU77 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CCDC179H3BU77 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CCDC179H3BU77 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CCDC179H3BU77 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CCDC179H3BU77 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CCDC179H3BU77 GREB1L-202ENST00000424526 6052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CCDC179H3BU77 DDC-201ENST00000357936 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CCDC179H3BU77 ASB9-209ENST00000546332 1947 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CCDC179H3BU77 MVK-213ENST00000625889 2591 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CCDC179H3BU77 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CCDC179H3BU77 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CCDC179H3BU77 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CCDC179H3BU77 SLC35F6-201ENST00000344420 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CCDC179H3BU77 SIRPA-201ENST00000356025 3867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CCDC179H3BU77 LINC00540-203ENST00000631321 2412 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CCDC179H3BU77 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CCDC179H3BU77 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CCDC179H3BU77 CHRNA7-224ENST00000637183 2912 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CCDC179H3BU77 SPTBN5-201ENST00000320955 11725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CCDC179H3BU77 ASAP3-201ENST00000336689 4050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CCDC179H3BU77 ABRA-201ENST00000311955 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CCDC179H3BU77 GOLGA8CP-201ENST00000446144 5237 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
CCDC179H3BU77 MADD-210ENST00000407859 5744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CCDC179H3BU77 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CCDC179H3BU77 CDC45-201ENST00000263201 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CCDC179H3BU77 NCBP2L-202ENST00000639756 1953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CCDC179H3BU77 ELP2-202ENST00000351393 2453 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CCDC179H3BU77 AARS-201ENST00000261772 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CCDC179H3BU77 C1QTNF9B-202ENST00000382140 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CCDC179H3BU77 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CCDC179H3BU77 VPS39-201ENST00000318006 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CCDC179H3BU77 AK4-201ENST00000327299 6836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CCDC179H3BU77 PDXK-209ENST00000467908 7194 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CCDC179H3BU77 CORO1C-201ENST00000261401 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CCDC179H3BU77 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CCDC179H3BU77 CLPB-203ENST00000437826 3379 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CCDC179H3BU77 ZNF304-203ENST00000443917 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CCDC179H3BU77 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
CCDC179H3BU77 SYNPO-204ENST00000519664 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
CCDC179H3BU77 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
CCDC179H3BU77 AK5-202ENST00000344720 3929 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
CCDC179H3BU77 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
CCDC179H3BU77 ATAT1-202ENST00000319027 2061 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
CCDC179H3BU77 TSNAXIP1-201ENST00000388833 2429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
CCDC179H3BU77 POMGNT1-203ENST00000396420 3480 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
CCDC179H3BU77 STRADA-201ENST00000245865 2959 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
CCDC179H3BU77 MAGEC3-201ENST00000298296 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
CCDC179H3BU77 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
CCDC179H3BU77 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
CCDC179H3BU77 LINC01907-201ENST00000415174 2609 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
CCDC179H3BU77 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
CCDC179H3BU77 APPBP2-201ENST00000083182 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
CCDC179H3BU77 RHOH-219ENST00000614836 2114 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
CCDC179H3BU77 PGAP2-204ENST00000396991 1798 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
CCDC179H3BU77 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
CCDC179H3BU77 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
CCDC179H3BU77 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
CCDC179H3BU77 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
CCDC179H3BU77 TIFAB-201ENST00000537858 5923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
CCDC179H3BU77 ABCB9-204ENST00000392439 3791 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
CCDC179H3BU77 ABCB9-206ENST00000442028 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
CCDC179H3BU77 ZPLD1-204ENST00000491959 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
CCDC179H3BU77 GRM4-205ENST00000538487 4153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
CCDC179H3BU77 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
CCDC179H3BU77 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
CCDC179H3BU77 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
CCDC179H3BU77 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
CCDC179H3BU77 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
CCDC179H3BU77 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
CCDC179H3BU77 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
CCDC179H3BU77 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
CCDC179H3BU77 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
CCDC179H3BU77 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
CCDC179H3BU77 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
CCDC179H3BU77 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
CCDC179H3BU77 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
CCDC179H3BU77 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC8.74□□□□□ -1.01
CCDC179H3BU77 CCDC112-201ENST00000379611 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
CCDC179H3BU77 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
CCDC179H3BU77 E2F8-205ENST00000620009 3519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
CCDC179H3BU77 AL162615.1-201ENST00000429893 1653 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
CCDC179H3BU77 AC092117.2-201ENST00000623937 1659 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
CCDC179H3BU77 BGN-201ENST00000331595 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms