Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NEDD8-MDP1E9PL57 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NEDD8-MDP1E9PL57 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms