Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SMIM1B2RUZ4 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms