Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 RN7SL275P-201ENST00000582762 335 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SOBPA7XYQ1 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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