Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 PMM1-201ENST00000216259 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 OR7E12P-201ENST00000344740 973 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 ECHDC2-201ENST00000358358 1126 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 AL162151.1-201ENST00000423922 561 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 AL357033.2-201ENST00000430184 739 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 HNRNPA3P12-201ENST00000437410 1063 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 AC022784.6-202ENST00000523246 674 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 AC079331.1-201ENST00000623200 1200 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 AL359182.1-201ENST00000435915 469 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 HLA-W-207ENST00000439514 771 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 SNRPF-205ENST00000553192 552 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 AC018845.3-201ENST00000562536 516 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 ACTBP9-201ENST00000587663 1099 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 AC112220.4-201ENST00000604982 1263 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 TARM1-202ENST00000616041 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 VPS28-201ENST00000292510 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 VPS28-202ENST00000377348 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 CDRT15L2-201ENST00000399044 1048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 CRYZL1-205ENST00000399442 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 AL137078.1-201ENST00000446280 404 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 VPS28-210ENST00000529182 1010 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 AL136040.1-201ENST00000557775 601 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 AC090282.1-201ENST00000572821 534 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 AP006248.1-201ENST00000610471 67 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 SNX20-205ENST00000610485 557 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 MRPS31P4-202ENST00000613769 583 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 KCNQ1OT1_1.1-201ENST00000622358 464 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 PAX6-237ENST00000638696 1203 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 NR1I2-206ENST00000638727 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 GNG4-201ENST00000366597 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 WNT8A-202ENST00000398754 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 PSMC5-212ENST00000581882 1474 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 MRPL55-209ENST00000366735 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 UCN3-201ENST00000380433 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 CYP4F29P-202ENST00000428301 1279 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 RPSAP69-201ENST00000445739 546 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 ALDOAP1-201ENST00000491506 1078 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 DLX6-203ENST00000555308 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 AC116025.1-201ENST00000575404 415 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 AC100786.1-201ENST00000583018 513 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RGPD3A6NKT7 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms